Skip to main content
Back to top
Ctrl
+
K
Getting started
MuData quickstart
muon tutorials
Documentation
Install muon
Input data
Multimodal data containers
Unimodal omics
ATAC-seq
CITE-seq
Multi-omics
Output data
API reference
muon.MuData
muon.pp
muon.pp.filter_obs
muon.pp.filter_var
muon.pp.intersect_obs
muon.pp.l2norm
muon.pp.neighbors
muon.pp.sample_obs
muon.tl
muon.tl.ica
muon.tl.leiden
muon.tl.louvain
muon.tl.mofa
muon.tl.snf
muon.tl.umap
muon.pl
muon.pl.embedding
muon.pl.histogram
muon.pl.mofa
muon.pl.mofa_loadings
muon.pl.scatter
muon.pl.umap
muon.utils
muon.atac.pp
muon.atac.pp.binarize
muon.atac.pp.scopen
muon.atac.pp.tfidf
muon.atac.tl
muon.atac.tl.add_genes_peaks_groups
muon.atac.tl.add_peak_annotation
muon.atac.tl.add_peak_annotation_gene_names
muon.atac.tl.count_fragments_features
muon.atac.tl.fetch_regions_to_df
muon.atac.tl.get_sequences
muon.atac.tl.initialise_default_files
muon.atac.tl.locate_file
muon.atac.tl.locate_fragments
muon.atac.tl.locate_genome
muon.atac.tl.lsi
muon.atac.tl.nucleosome_signal
muon.atac.tl.rank_peaks_groups
muon.atac.tl.scan_sequences
muon.atac.tl.tss_enrichment
muon.atac.pl
muon.atac.pl.dotplot
muon.atac.pl.embedding
muon.atac.pl.fragment_histogram
muon.atac.pl.lsi
muon.atac.pl.mofa
muon.atac.pl.pca
muon.atac.pl.tss_enrichment
muon.atac.pl.umap
muon.prot.pp
muon.prot.pp.clr
muon.prot.pp.dsb
initialise_default_files
read_10x_h5
read_10x_mtx
Release notes
.rst
.pdf
muon.utils
muon.utils
#
